Medizinisches Proteom-Center
Medizinische Proteomanalyse, Zentrum für Proteindiagnostik (PRODI)
Medizinische Fakultät
Ruhr-Universität Bochum
Gesundheitscampus 4
44801 Bochum
Raum:
E2.259
Tel:
+49 (0)234 32-18106
Email:
katrin.marcus@ruhr-uni-bochum.de
Seit 2014 leite ich das Medizinische Proteom-Center an der Medizinischen Fakultät der Ruhr-Universität Bochum. Meine Expertise liegt im Bereich der medizinischen Proteomanalyse mit speziellem Fokus auf neurodegenerative Erkrankungen wie Morbus Parkinson. Zusammen mit vielen Kooperationspartnern suchen wir nach den zugrundeliegenden Pathomechanismen dieser Erkrankungen. Darüber hinaus suchen wir unter Einsatz der neuesten Ansätze der Proteomik und durch stetige Weiterentwicklung der verfügbaren Technologien nach Proteinbiomarkern, die eine Früh- und Verlaufsdiagnose dieser Erkrankungen erlauben. Für diese Anwendungen haben wir eine umfassende, statistisch validierte Analysestrategie entwickelt, die eine ausgefeilte Probenpräparation für verschiedenstes Probenmaterial (Gewebe, Körperflüssigkeiten, Zellen etc.), die Protein- bzw. Peptidtrennung, die Detektion von modifizierten Proteinspezies, die Proteinidentifizierung/-quantifizierung mittels Massenspektrometrie und Validierung der Kandidatenproteine mittels Antikörper-basierter Methoden und zielgerichteter Massenspektrometrie umfasst. Immer mehr betreten wir nun auch den Bereich der funktionellen Proteomik mit Methoden der Molekularbiologie, Zellkultur, verschiedenen funktionellen Assays und Immunhistochemie, mit Hilfe derer wir in der Lage sind, die Funktionen einzelner identifizierter Proteine zu beleuchten. Seit Kurzem haben wir auch die Lipidomics mit in unser Portfolio aufgenommen. Die Bioinformatik ist über die Jahre hinweg ein sehr wichtiger Teil unserer Arbeit geworden und wir entwickeln hier Tools und Ansätze zur optimalen Auswertung unserer umfangreichen Daten, zur Integration der OMICS-Daten mit klinischen Daten und einer verbesserten Statistik.
Zang, J. C. S., May, C., Hellwig, B., Moser, D., Hengstler, J. G., Cole, S., Heinrichs, M., Rahnenführer, J., Marcus, K., & Kumsta, R. (2023). Proteome analysis of monocytes implicates altered mitochondrial biology in adults reporting adverse childhood experiences. Translational Psychiatry, 13(1), 31. https://doi.org/10.1038/s41398-023-02320-w
Wulf, M., Barkovits, K., Schork, K., Eisenacher, M., Riederer, P., Gerlach, M., Eggers, B., & Marcus, K. (2022). Neuromelanin granules of the substantia nigra: Proteomic profile provides links to tyrosine hydroxylase, stress granules and lysosomes. Journal of Neural Transmission (Vienna, Austria : 1996), 129(10), 1257–1270. https://doi.org/10.1007/s00702-022-02530-4
Caldi Gomes, L., Roser, A.‑E., Jain, G., Pena Centeno, T., Maass, F., Schilde, L., May, C., Schneider, A., Bähr, M., Marcus, K., Fischer, A., & Lingor, P. (2021). MicroRNAs from extracellular vesicles as a signature for Parkinson's disease. Clinical and Translational Medicine, 11(4), e357. https://doi.org/10.1002/ctm2.357
Barkovits, K., Kruse, N., Linden, A., Tönges, L., Pfeiffer, K., Mollenhauer, B., & Marcus, K. (2020). Blood Contamination in CSF and Its Impact on Quantitative Analysis of Alpha-Synuclein. Cells, 9(2). https://doi.org/10.3390/cells9020370
Barkovits, K., Pacharra, S., Pfeiffer, K., Steinbach, S., Eisenacher, M., Marcus, K. & Uszkoreit, J. (2020). Reproducibility, Specificity and Accuracy of Relative Quantification Using Spectral Library-based Data-independent Acquisition. Molecular & Cellular Proteomics, 19(1), 181–197. https://doi.org/10.1074/mcp.ra119.001714
Boussaad, I., Obermaier, C. D., Hanss, Z., Bobbili, D. R., Bolognin, S., Glaab, E., Wołyńska, K., Weisschuh, N., Conti, L. de, May, C., Giesert, F., Grossmann, D., Lambert, A., Kirchen, S., Biryukov, M., Burbulla, L. F., Massart, F., Bohler, J., Cruciani, G., Marcus, K., . . . Krüger, R. (2020). A patient-based model of RNA mis-splicing uncovers treatment targets in Parkinson's disease. Science Translational Medicine, 12(560). https://doi.org/10.1126/scitranslmed.aau3960
Plum, S., Eggers, B., Helling, S., Stepath, M., Theiss, C., Leite, R. E. P., Molina, M., Grinberg, L. T., Riederer, P., Gerlach, M., May, C., & Marcus, K. (2020). Proteomic Characterization of Synaptosomes from Human Substantia Nigra Indicates Altered Mitochondrial Translation in Parkinson's Disease. Cells, 9(12). https://doi.org/10.3390/cells9122580
Kley, R. A., Maerkens, A., Leber, Y., Theis, V., Schreiner, A., van der Ven, P. F. M., Uszkoreit, J., Stephan, C., Eulitz, S., Euler, N., Kirschner, J., Müller, K., Meyer, H. E., Tegenthoff, M., Fürst, D. O., Vorgerd, M., Müller, T., & Marcus, K. (2013). A combined laser microdissection and mass spectrometry approach reveals new disease relevant proteins accumulating in aggregates of filaminopathy patients. Molecular & Cellular Proteomics : MCP, 12(1), 215–227. https://doi.org/10.1074/mcp.M112.023176
Tribl, F., Asan, E., Arzberger, T., Tatschner, T., Langenfeld, E., Meyer, H. E., Bringmann, G., Riederer, P., Gerlach, M., & Marcus, K. (2009). Identification of L-ferritin in neuromelanin granules of the human substantia nigra: A targeted proteomics approach. Molecular & Cellular Proteomics : MCP, 8(8), 1832–1838. https://doi.org/10.1074/mcp.M900006-MCP200
Klose, J., Nock, C., Herrmann, M., Stühler, K., Marcus, K., Blüggel, M., Krause, E., Schalkwyk, L. C., Rastan, S., Brown, S. D. M., Büssow, K., Himmelbauer, H., & Lehrach, H. (2002). Genetic analysis of the mouse brain proteome. Nature Genetics, 30(4), 385–393. https://doi.org/10.1038/ng861
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Letzte Änderung: 24. Sep. 2024
